构建具有中国特色的学科体系是建构中国自主知识体系的重要内容之一，也是构建中国特色哲学社会科学的必由之路。中国经济社会发展的巨大成就与中国应用经济学学科不断发展壮大使构建中国特色的应用经济学学科体系具有了必要性与可能性。中国特色应用经济学学科体系需要以本质规律为基础构建学科建设大格局，以全维度为框架推动学科建设体系化，以特色化为抓手引领学科建设创新发展。应用经济学学科建设需要深入了解其历史逻辑、理论逻辑与实践逻辑，运用历史唯物主义与辩证唯物主义的根本方法，确定不同阶段、不同地区建设发展的重点与难点，强化内涵建设，突出特色发展，构建出具有中国特色和世界意义的应用经济学学科体系。