专业认同是高校学生提高学习主动性和学习效率的内在驱动力。如何有效提升学生专业认同度，是高等农业院校激发学生学习公共管理类专业兴趣和培养卓越农村公共管理人才必须回答的问题。从学生个体特征、家庭特征以及专业教育条件、教育过程、教育效果5个维度15个因素提出研究假设，依据我国6所高等农业院校681名公共管理类专业学生调查数据，采用二分类Logistic回归模型，实证分析学生专业认同度及其影响因素。研究结果表明，学生认同度总体上不太高，尚有相当大的提升空间，受学生性别、专业办学硬件条件等5个因素影响不显著，受学生专业选择意愿、专业情感、专业行动等10个因素影响显著，且影响方式与程度存在明显差异。对此，应该聚焦学生内在需求与兴趣培养，做好专业宣传推介、改善专业教育条件、优化专业教育过程和加强专业认同教育，以提升学生对高等农业院校公共管理类专业认同度，引导学生自觉投身于新时代农业农村现代化伟大事业中。