课程建设是研究生培养环节重要的基础性工作。“森林生态系统理论与应用”课程是林业硕士掌握坚实的林业基础理论和系统专门知识的主要途径及桥梁课程。采用面向学生的问卷调查和面向教师的调研相结合的方式，探讨新疆农业大学面向林业硕士开设的“森林生态系统理论与应用”课程建设中存在的问题，结合新的课程建设思路，提出更优质的课程建设具体方案，对整个课程体系内的教学内容、考核方式以及教学方法与手段等方面进行全面优化，旨在提高林业硕士研究生的专业实践能力，达到培养出服务于林业行业优秀人才的目标。